Το Μαρκό ήταν η τελευταία χρονικά ομάδα που εξασφάλισε την πρόκρισή της στη League Phase του Κυπέλλου Ελλάδας. Έτσι, έχουν πλέον κλειδώσει οι 15 από τις 16 θέσεις της επόμενης φάσης.
Στη League Phase βρίσκονται επίσης οι ΑΕΚ, Ολυμπιακός, ΠΑΟΚ, Παναθηναϊκός, ΟΦΗ, Άρης, Βόλος Elabet, Ατρόμητος, Κηφισιά, ΑΕΛ, Πανσερραϊκός, Καλαμάτα, Νίκη Βόλου και Νέστος Χρυσούπολης.
Η μοναδική εκκρεμότητα αφορά τον Λεβαδειακό και τον Αστέρα Τρίπολης. Οι Βοιωτοί επικράτησαν με 2-0, όμως ο Αστέρας κατέθεσε ένσταση για αντικανονική συμμετοχή παίκτη του Λεβαδειακού. Η απόφαση του αρμόδιου οργάνου θα κρίνει ποια ομάδα θα συνεχίσει.
Πριν από την κλήρωση θα δημιουργηθεί ενιαίος πίνακας κατάταξης, με βασικό κριτήριο την τελική θέση κάθε ομάδας στο πρωτάθλημά της για τη σεζόν 2025/26. Οι 16 ομάδες θα χωριστούν σε τέσσερα γκρουπ δυναμικότητας και κάθε μία θα δώσει τέσσερις αγώνες, δύο εντός και δύο εκτός έδρας.
Συνολικά θα διεξαχθούν 32 παιχνίδια. Οι τέσσερις πρώτες ομάδες της βαθμολογίας θα προκριθούν απευθείας στα προημιτελικά, οι επόμενες οκτώ θα αγωνιστούν στα Play Offs, ενώ τέσσερις θα αποκλειστούν.
Η League Phase θα διεξαχθεί από την 1η έως τις 3 Σεπτεμβρίου, από τις 8 έως τις 10 Σεπτεμβρίου, από τις 15 έως τις 17 Σεπτεμβρίου, από τις 27 έως τις 29 Οκτωβρίου και στις 2 Δεκεμβρίου, όταν όλοι οι αγώνες θα γίνουν την ίδια ώρα.